Αν και πρόκειται για μία από τις νεότερες ομάδες της κατηγορίας, με έτος σύστασης το 2015, τα Γιάννενα WFC κατάφεραν να ξεχωρίσουν από την πρώτη σεζόν της συμμετοχής τους στην κορυφαία κατηγορία του γυναικείου ποδοσφαίρου για το δυναμισμό, την ποιότητα και το σταθερό αγωνιστικό τους πρόσωπο.
Με την εμπειρία που τους προσέφερε η ένωση με την Προοδευτική Περάματος και ο «νεανικός» ενθουσιασμός των φιλόδοξων παραγόντων, η γυναικεία ομάδα των Ιωαννίνων ανέβηκε αμέσως - το 2018- στην Α’ Εθνική και έκτοτε παραμένει ανάμεσα στα πιο αξιοπρόσεκτα κλαμπ της κατηγορίας.